Глава M. Методика

M.4. Ресурсы

Назад Вперед
M.4.1.3. Информационные серверы и базы данных

►База данных по биологии человека Rus
http://obi.img.ras.ru
Большой по объёму ресурс, который содержит много информации высокого научного уровня, охватывающей не только биологию человека, но и ряд вопросов общей биологии (в частности, молекулярную и клеточную биологию). Относительно неудобная навигация, необходимость частого перехода между страницами несколько усложняют работу с неплохим по содержащейся информации ресурсом.
Ресурс представлен практически исключительно текстовыми и табличными материалами.
►The RCSB Protein Data Bank (Международный банк белковых структур) Eng
http://www.rcsb.org/
Мощнейший банк научной информации о структурах всех изученных белков, в котором можно найти (и бесплатно скачать) трёхмерные модели конкретных белков и научиться изменять их способ отображения. Для работы с моделями белков потребуется программа RasMol (версия под Windows – RasWin), которую можно скачать с сайта разработчиков «Бернштейн и сыновья». Каталоги трехмерных моделей молекул есть также на сайтах MathMol (наиболее интересные микромолекулы – сахара, аминокислоты, липиды, лекарственные препараты) и Klotho (большой набор биологически активных микромолекул).
Основные действия, необходимые для поиска интересующих молекул в Protein Data Bank при минимальном знании английского языка описаны в уроке «Экскурсия по PDB»
1
Рисунок M.4.1.3.1
►National Center for Biotechnology Information Eng
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Национальный центр биотехнологической информации США (Бетезда, штат Мэриленд, Национальные институты здоровья). Мощный портал, на котором представлены ресурсы по всем аспектам изучения и практического применения результатов геномных исследований. В его состав входят: About NCBI – научные основы ресурса, введение для учёных, преподавателей и интересующихся; GenBank – представлены результаты секвенирования генов разных объектов; Literature databases – текстовые базы данных (PubMed – каталог рефератов научных статей, содержащий (на осень 2002 г.) 16 миллионов рефератов и сотни тысяч полнотекстовых статей; OMIM – каталог хромосомных карт В. Маккьюсика и др.); Molecular databases – молекулярные базы данных: последовательности, структуры и новые подходы к систематике. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/ – Таксономия по особенностям генетического кода организмов и их митохондрий. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ – программа, которая сравнивает нуклеотидные и аминокислотные последовательности (поиск гомологов среди изученных макромолекул). Genomic biology – геном человека, полные геномы других изученных организмов. Software – программное обеспечение (например, собственная программа визуализации молекул). Education – учебные ресурсы и on-line пособия.
Для подготовленных пользователей.
2
Рисунок M.4.1.3.2
►OMIM Eng
http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/searchomim.html
База данных хромосомных карт человека. Представлены все хромосомы кариотипа человека в виде физических карт, условных карт со схемами расположения генов.
Для демонстрации на уроках желательно скопировать некоторое количество изображений; возможна и работа с ресурсом в режиме онлайн при тщательной постановке учебно-поисковых задач.
3
Рисунок M.4.1.3.3
►Базы данных по молекулярной биологии Eng
http://molbio.info.nih.gov/molbio/db.html
Каталог баз данных по геномам, ДНК, белкам, хромосомам; ссылки классифицированы по рубрикам.
4
Рисунок M.4.1.3.4
►MEDLINEplus Eng
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/
Информационная служба Национальной медицинской библиотеки США «МЕДЛАЙНплюс» (MEDLINEplus) призвана помогать пользователям находить ресурсы, содержащие информацию, которая поможет им в изучении вопросов здравоохранения. Эта служба предоставляет доступ к обширному массиву информации о конкретных заболеваниях и состояниях и содержит ссылки на медицинскую информацию для потребителей, публикуемую Национальными институтами здравоохранения и информационными службами, а также словари, списки больниц и врачей, медицинскую информацию на различных языках и клинические испытания.
5
Рисунок M.4.1.3.5
►Сайт молекулярных биологов Rus
http://molbiol.edu.ru/
Удобный и тщательно продуманный ресурс, созданный молекулярными биологами для молекулярных биологов. Учебные пособия, обзор методик исследования и программного обеспечения, удобная навигация и предусмотренная авторами возможность создания оффлайновой версии сайта. http://molbiol.ru/protocol/ – База данных по различным методам молекулярной биологии, которые применяются в биотехнологии. Большой и очень хороший гипертекстовый учебник, содержащий «суммы технологий» современной молекулярной генетики, необходимые как для понимания сути генно-инженерных работ, так и для практической деятельности в высокотехнологичных направлениях биотехнологии.
6
Рисунок M.4.1.3.6
►Apoptosis Special Interest Site Eng
http://biochem.boehringer-mannheim.com/apoptosis/index.htm
Подробный и полный ресурс (созданный Roche Diagnostics Corporation, http://biochem.roche.com/) по апоптозу – с большой комментированной схемой, текстовым описанием этапов процесса и его биологического значения.
Оптимизирован под разрешение 1024 x 768 пикселей.
7
Рисунок M.4.1.3.7
►«Редкие и исчезающие животные России» Rus
http://nature.ok.ru/
Веб-проект, предлагающий подробные описания редких и исчезающих животных России, их изображения, карты ареалов, а также голоса ряда животных (более 30 записей, преимущественно птиц и хищных млекопитающих) и видеоматериалы на темы охраны исчезающих животных.
Для использования на уроке звуковых и видеофайлов их желательно предварительно скопировать и сохранить, для проведения урока (-ов) стоит предусмотреть порядок работы с сайтом, задания для учеников.
8
Рисунок M.4.1.3.8

Назад Вперед
Наверх

Включить/Выключить фоновую музыкуВключить/Выключить звуки событий